一、4月13日之後營利事業登記證正式廢除

行政院於98年3月12日院臺經字第0980006249D號令核定：營利事業統一發證制度之施行期限至98年4月12日止，亦即自98年4月13日起，公司組織依公司法辦理公司登記；獨資、合夥之商業依商業登記法辦理商業登記後，而毋庸再行辦理「營利事業登記」及取得「營利事業登記證」。

二、都計、建管、衛生及消防自行管理

公司行號於核准後，主管機關會以電子公文副知稅捐、都計、建管、消防、衛生等單位，並於公文內寫明『實際經營之營業場所仍應符合都市計劃、建築管理、消防及衛生等法令規定』等字樣。這等意思即是說，4月13日以後只有單純廢除『營利事業登記證』的發行，並沒有廢除管理的法令，公司行號營業場所仍然需受都市計畫法、建築法、消防法及食品衛生法等等規範。以前有張『營利事業登記證』來告知營業場所是否合法，4月13日以後營業場所管理回歸各營業人，亦即，營業場所如果違法了，業者在不知情的情況下，仍會被罰！至於罰金多少，可參考第四點說明。
『非法容易，合法難』，在可遇見的將來，想必然一定會存在許多『既合法又非法』，也就是表面上看起來已完成商業登記，但實際上卻又違反都計、建管、消防及衛生等相關規定的普通現象，到時候相關單位若真得有足夠人力來稽察，恐怕被處罰的民眾也必然叫苦連天，更害慘了經驗不足的代辦業者，相關衍生的問題，不可不加以正視。

三、申辦程序變的簡單，使用上卻變得複雜！

4月13日以前公司登記的程序中，營業地址的合法性扮演最後成敗的關鍵，這個關鍵以前有縣市政府幫忙把關，幫忙背書。4月13日起，公司登記核准後，營業人再去國稅局辦理營業登記、買發票即可開始營業，表面上看起來是繞過煩人的營利事業登記證關卡，但中間卻隱藏更大的風險！
有去台北縣政府臨櫃辦過營利事業登記證的人都知道，像縣政府這麼專業的人員都得一字排開，各單位指派相關人等分別審理，複雜的案件更需會辦好幾個禮拜。試問！一個市井小民如何勝任？多如牛毛的都計、建管、消防、衛生法令，又如何才能知法不犯法？既是如此，又如何叫營業人自行管理？這真得就好像讓習慣開賓士的人去駕馭脫僵的野馬，絕非技術不好，只是對象錯誤。
倘若消費者或一般民眾誤認為已完成商業登記的公司行號，在消防衛生等也必然合乎規定，尚不知此變革後，若因意外發生所導致的重大傷亡，或違及消費者生命財產時，其責任固然應歸咎在經營者身上，但試問，難道公家單位都不必儘到監督管理的責任嗎？

四、自行申請前，先了解罰款有多重

(一)違反都市計畫： 處新臺幣六萬元以上三十萬元以下罰鍰，並勒令拆除、改建 、停止使用或恢復原狀。不遵規定者，除應依法予以行政強 制執行外，並得處六個月以下有期徒刑或拘役。(都市計畫法第79條、80條)

(二)違反建築物使用類組規定： 處新臺幣六萬元以上三十萬元以下罰鍰，並限期改善或補辦手續，屆期仍未改善或補辦手續而繼續使用者，得連續處罰，並限期停止其使用。 (建築法第91條)

(三)違反消防法令： 應設置消防安全設備之供營業使用場所，其管理權人未依 規定設置或維護，於發生火災時致人於死者，處一年以上七年以下有期徒 刑，得併科新台幣一百萬元以上五百萬元以下罰金；致重傷者，處六月以 上五年以下有期徒刑，得併科新台幣五十萬元以上二百五十萬元以下罰金 。(消防法35條)

(四) 違反衛生法令： 處新臺幣六萬元以上三十萬元以下罰鍰；一年內再次 違反者，並得廢止其營業或工廠登記證照(食品衛生法第31條 )

五、真得要安心，煩人的程序不能廢

根據經濟部4月8日新聞稿提到有關於廢證之後，為利業者能夠更清楚了解營業場所是否符合都計、建管、消防及衛生規定，提出了以下幾點配套措施：

(一)內政部協商各縣市政府設立『諮詢服務窗口』：

短期內請內政部儘速召集各縣市政府研商設立「諮詢服務窗口」，以便利民眾得透過此窗口查詢其營業處所之土地使用分區、建築物使用及所得經營之業務；並配合「諮詢服務窗口」設置，由縣市政府消防主管機關，就應加會消防單位之行業別提供予民眾知悉。

(二)請內政部加強對民眾宣導『諮詢服務窗口』的功能。

(三)國稅局進駐各縣市聯合作業中之的作業人員暫緩徹離。

根據本所4月14日派員到台北市政府商業處、建管處詢問結果，台北市政府聯合服務作業中心已撤離，並已不再提供『建築物用途預審』，更重要的是，市政府好像也沒有設置什麼『詢問服務窗口』！！？

希望這只是過渡的協商時期，不然，真不知道對於完全不懂都市建管法令的市井小民如何辦理？如何自保？還是強迫業者先做了再說？再者，過去太過依賴預審制度的代辦業者，將不知道如何確切提供客戶保證？會不會有先把簡單的登記代辦費用賺進來，再等事後管理罰款大刀開鍘的時候再閃一邊？

台北縣的情況，在以前統一發證櫃台以前建管人員所坐的地點，設置有都計、建管及國稅局的詢問窗口，營業人若有需有可以善加利用。不過，經片面了解，在5月之後，該諮詢窗口就從聯合發證櫃台撤回各科服務櫃台。

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